Des contacts symptomatiques signalés dans le cadre d’une enquête sur un cas de grippe H5N1 dans le Missouri

Le 13 septembre, les Centres pour le contrôle et la prévention des maladies (CDC) ont partagé de nouvelles informations des autorités du Missouri sur un cas de grippe aviaire humaine H5 récemment signalé, notamment qu’un contact familial est tombé malade avec des symptômes similaires le même jour et qu’un professionnel de la santé présentait des symptômes légers.

Dans un autre développement clé, les CDC ont détaillé les résultats du séquençage génétique du virus dans l’échantillon clinique du patient, y compris la confirmation que la neuraminidase est N1. Bien que tous les gènes n’aient pas pu être séquencés en raison de la faible quantité de matériel génétique dans l’échantillon du patient, les travaux de laboratoire ont trouvé davantage de preuves que le virus H5N1 qui a infecté ce patient est étroitement lié au virus de la vache laitière américaine.

Le moment de l’apparition de la maladie dans le foyer laisse entrevoir une exposition commune

La nouvelle de contacts symptomatiques a été une surprise, après qu’un responsable du CDC a déclaré la veille que les preuves jusqu’à présent indiquaient un cas « unique ». Le CDC avait déclaré que les responsables de la santé du Missouri dirigeaient l’enquête, mais qu’il était en contact étroit, presque quotidien, avec le département de la santé de l’État au sujet de ce cas. Jusqu’à présent, aucun lien avec les animaux ou le lait cru n’a été trouvé.

Dans un 13 septembre mise à jour de la situationle CDC a déclaré que l’État avait ensuite partagé des informations sur deux contacts symptomatiques. L’un est le contact familial du patient, qui a présenté des symptômes similaires le même jour. Le patient n’a pas été testé et s’est depuis rétabli.

Le patient index a été hospitalisé pour une condition médicale sous-jacente importante et a été signalé à l’hôpital avec des douleurs thoraciques, des nausées, des vomissements, de la diarrhée et une faiblesse. Cependant, la personne n’était pas gravement malade et n’a pas été transférée à l’unité de soins intensifs. Le CDC avait déclaré plus tôt qu’un panel respiratoire avait été effectué pendant l’hospitalisation, qui avait révélé un résultat positif pour la grippe qui a été regroupé avec d’autres échantillons et envoyé au laboratoire d’État pour sous-typage.

Le patient a reçu un traitement antiviral, a pu quitter l’hôpital et s’est rétabli. « Le développement simultané des symptômes ne suggère pas une transmission interhumaine, mais suggère une exposition commune », a déclaré le CDC.

Les responsables du Missouri ont également déclaré au CDC qu’un agent de santé avait développé des symptômes légers mais avait été testé négatif pour la grippe.

Lors du briefing de la semaine dernière, un responsable du CDC a déclaré que des tests sérologiques pour l’infection H5 avaient été discutés pour les contacts du patient index, mais qu’il était probablement trop tôt pour trouver des niveaux d’anticorps détectables.

Le séquençage révèle 2 mutations HA et confirme N1

Dans sa mise à jour, le CDC a également partagé les résultats du séquençage, qui a été limité par la faible quantité de matériel génétique dans le virus de la grippe provenant de l’échantillon du patient. Les scientifiques du CDC ont pu séquencer entièrement les gènes de la matrice (M) et non structurels (NS), mais n’ont pu séquencer que partiellement les gènes de l’hémagglutinine (HA) et de la neuraminidase (NA).

L’analyse de la séquence HA confirme que le virus du patient appartient au clade 2.3.4.4b et l’analyse NA confirme N1. Le CDC a déclaré qu’il y avait deux substitutions d’acides aminés dans la séquence HA qui n’ont pas été observées dans d’autres cas humains, et bien qu’elles ne soient pas censées affecter l’infectiosité ou la propagation, elles sont situées sur une zone du virus qui pourrait affecter la réactivité croisée des virus candidats au vaccin 2.3.4.4b. L’une des différences HA (HA A156T) a été observée dans moins de 1 % des échantillons de vaches laitières, et l’autre (HA P136S) n’est apparue que dans une seule séquence de vaches laitières.

Lors d’autres tests effectués sur l’échantillon, les CDC ont déclaré n’avoir trouvé aucun marqueur de sensibilité réduite aux médicaments antiviraux inhibiteurs de la neuraminidase ni aucune mutation liée à un potentiel accru de propagation interhumaine. Malgré de multiples tentatives, les scientifiques n’ont pas réussi à cultiver le virus à partir de l’échantillon du patient.

Un virologue s’exprime sur les implications des mutations

Après que le CDC a soumis les séquences à deux bases de données, d’autres laboratoires ont commencé à analyser les résultats. Jesse Bloom, PhD, MPhil, qui dirige le Bloom Lab qui étudie l’évolution des virus au Fred Hutchinson Cancer Center à Seattle, dit sur X Selon les travaux antérieurs d’un scientifique de l’équipe, la mutation A160T (qui correspond à A156T dans la numérotation H5) provoque une diminution de 10 à 100 fois de la neutralisation par les sérums des furets exposés au virus candidat vaccinal actuel. Il a ajouté que, jusqu’à présent, la mutation n’a été observée que chez une poignée de vaches laitières infectées.

Il a noté que la mutation souligne les défis de l’approche du virus vaccinal candidat, ajoutant que la mise à jour du CDC reconnaît l’implication potentielle.

Bloom a déclaré que même si la deuxième mutation se trouve dans la région antigénique de la tête de l’HA, elle ne semble pas avoir beaucoup d’impact sur la neutralisation. Il a cependant déclaré qu’elle pourrait légèrement affecter la liaison au récepteur. Il a déclaré que la mutation, référencée comme P136S dans la mise à jour du CDC, mérite une étude plus approfondie en raison d’une amélioration modeste estimée de la liaison au récepteur et du fait qu’elle a été trouvée dans le cas humain du Missouri, même si elle n’avait été trouvée que dans une seule des nombreuses séquences connues de vaches laitières.