Résumé: Les chercheurs ont développé TRISCO, une méthode de microscopie de pointe qui permet l’analyse 3D de l’ARN dans des cerveaux de souris entiers et intacts sans les découper en sections. TRISCO révèle la distribution spatiale des molécules d’ARN, fournissant ainsi des informations sans précédent sur la structure et la fonction complexes du cerveau.
La technique a le potentiel d’analyser jusqu’à 100 molécules d’ARN simultanément, ouvrant la voie à des études avancées sur la fonction cérébrale et les maladies. Cette avancée pourrait révolutionner notre compréhension des troubles neurologiques et conduire à des traitements innovants.
Faits clés :
- TRISCO permet l’imagerie tridimensionnelle de l’ARN dans des cerveaux de souris entiers et intacts.
- Il peut analyser plusieurs molécules d’ARN simultanément, et pourra bientôt atteindre 100.
- La méthode est applicable aux cerveaux plus gros et à d’autres tissus comme le cœur et les reins.
Source: Institut Karolinska
Des chercheurs du Karolinska Institutet et de l’hôpital universitaire de Karolinska ont développé une méthode de microscopie révolutionnaire qui permet une analyse tridimensionnelle détaillée (3D) de l’ARN à résolution cellulaire dans des cerveaux entiers de souris intacts.
La nouvelle méthode, appelée TRISCO, a le potentiel de transformer notre compréhension du fonctionnement cérébral, à la fois dans des conditions normales et en cas de maladie, selon la nouvelle étude publiée dans Science.
Malgré les progrès considérables réalisés dans l’analyse de l’ARN, relier les données sur l’ARN à son contexte spatial constitue depuis longtemps un défi, en particulier dans les volumes de tissus 3D intacts. La méthode TRISCO permet désormais de réaliser une imagerie tridimensionnelle de l’ARN de cerveaux entiers de souris sans avoir besoin de découper le cerveau en fines sections, ce qui était auparavant nécessaire.
« Cette méthode est un outil puissant qui peut faire avancer la recherche sur le cerveau. Avec TRISCO, nous pouvons étudier la structure anatomique complexe du cerveau d’une manière qui n’était pas possible auparavant », explique Per Uhlén, professeur au Département de biochimie médicale et de biophysique du Karolinska Institutet et dernier auteur de l’étude.
Dans l’étude, jusqu’à trois molécules d’ARN différentes ont été analysées simultanément. La prochaine étape pour les chercheurs consiste à augmenter le nombre de molécules d’ARN pouvant être étudiées à une centaine, en utilisant une technique appelée analyse multiplex de l’ARN. Cela pourrait fournir des informations encore plus détaillées sur la fonction cérébrale et les états pathologiques.
L’approche TRISCO ouvre de nouvelles possibilités pour comprendre en profondeur la complexité du cerveau, ce qui peut conduire au développement de nouveaux traitements pour diverses maladies cérébrales.
«Nous sommes impatients de poursuivre nos recherches et d’explorer les nombreuses possibilités offertes par cette nouvelle technique», déclare Shigeaki Kanatani, chercheur spécialisé au laboratoire d’Uhlén et premier auteur de l’étude.
Non seulement TRISCO convient à l’étude des cerveaux intacts de souris, mais l’étude démontre qu’il peut être utilisé pour des cerveaux plus gros, comme ceux de cobayes, et pour divers tissus comme les reins, le cœur et les poumons. L’étude est une collaboration entre le Karolinska Institutet et l’hôpital universitaire de Karolinska.
« Notre laboratoire entretient plusieurs collaborations avec des chercheurs cliniquement actifs de l’hôpital universitaire Karolinska. Il est crucial pour la recherche biomédicale que les chercheurs fondamentaux et les cliniciens collaborent et se comprennent », explique Per Uhlén.
Financement: L’étude a été financée par le Conseil suédois de la recherche, la Fondation suédoise du cerveau et la Société suédoise du cancer. Certains des co-auteurs sont salariés et possèdent des actions dans la société danoise Gubra. Aucun autre conflit d’intérêt n’est signalé.
À propos de cette actualité de la recherche sur l’ARN et la neuroimagerie
Auteur: Bureau de presse
Source: Institut Karolinska
Contact: Bureau de presse – Institut Karolinska
Image: L’image est attribuée à Science
Recherche originale : Accès fermé.
« Analyse transcriptionnelle spatiale du cerveau entier à résolution cellulaire» de Per Uhlén et al. Science
Abstrait
Analyse transcriptionnelle spatiale du cerveau entier à résolution cellulaire
Les progrès récents dans l’analyse de l’ARN ont approfondi notre compréhension des états cellulaires des tissus biologiques. Cependant, il reste une lacune importante dans l’intégration des données sur l’expression de l’ARN avec le contexte spatial à travers les organes, principalement en raison des défis associés à la détection de l’ARN dans des volumes de tissus intacts.
Ici, nous avons développé la rétention médiée par le tampon Tris du signal de réaction en chaîne d’hybridation in situ dans les organes nettoyés (TRISCO), une méthode efficace de nettoyage des tissus conçue pour l’imagerie spatiale tridimensionnelle (3D) de l’ARN du cerveau entier.
TRISCO a résolu plusieurs problèmes cruciaux, notamment la préservation de l’intégrité de l’ARN, l’obtention d’un marquage uniforme de l’ARN et l’amélioration de la transparence des tissus.
Nous avons testé TRISCO en utilisant une large gamme de marqueurs d’identité cellulaire, d’ARN non codants et dépendants de l’activité, dans divers organes de différentes tailles et espèces.
TRISCO apparaît ainsi comme un outil puissant pour l’imagerie 3D unicellulaire du cerveau entier qui permet une analyse spatiale transcriptionnelle complète dans l’ensemble du cerveau.
